謝明輝提出7大請辭理由，包括陸客縮減、兩岸共同打擊犯罪協(xié)議失效、蔡就職演說被評為“沒有完成的答卷”、當(dāng)局無法維護(hù)南海權(quán)益、雄三飛彈釀兩岸危機(jī)、兩岸服貨貿(mào)協(xié)議卡關(guān)，以及任用深綠背景的田弘茂擔(dān)任海基會董事長。他預(yù)期兩岸關(guān)系將陷入全面停擺，海基會也無法發(fā)揮功能，因此辭去顧問一職。

謝明輝受訪表示，蔡當(dāng)局政策上不承認(rèn)“九二共識”，海基會董座又選擇深綠人士出任，等于在兩岸關(guān)系政策及人事兩層面上，都選擇“冰封”，并非善意展現(xiàn)。蔡任用田弘茂，他認(rèn)為這是蔡向深綠靠攏，代表親美日遠(yuǎn)大陸的立場明確化，兩岸正式從“冷和平”階段進(jìn)入“冷對抗”時(shí)期，“外交”經(jīng)貿(mào)將全面遍地烽火。

他預(yù)判，未來海基會將連最重要的服務(wù)臺商功能都喪失掉，回到陳水扁時(shí)代虛級化機(jī)構(gòu)。再加上“立法院”正刪減海基會預(yù)算，業(yè)務(wù)勢必縮編，大陸臺商往后僅能自力救濟(jì)，組成臺商協(xié)會以取代海基會的功能。