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新技術(shù)能窺探更細微基因變異

2017年04月18日 11:02 | 來源:健康報網(wǎng)
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中美研究人員在新一期美國《科學》雜志上報告說,他們研制出一種新型單細胞全基因組擴增技術(shù),在此基礎(chǔ)上不僅有望避免許多遺傳性疾病遺傳給后代,從基因組角度更深入地認識癌癥也將成為可能。

單細胞研究是當前生命科學研究的重要方向之一。許多關(guān)鍵的生命活動都和細胞間個體差異密切相關(guān);許多重要的生命科學和醫(yī)學問題所能依賴的樣品往往也是極少數(shù)細胞。但在相關(guān)研究中,由于單個細胞中的DNA(脫氧核糖核酸)的含量極少,先需要通過全基因組擴增技術(shù)將DNA進行擴增,從而便于單細胞測序。

最新單細胞擴增技術(shù)名為LIANTI,由美國科學院院士謝曉亮教授領(lǐng)導的研究團隊經(jīng)4年努力研發(fā)而成。謝曉亮同時在哈佛大學和北京大學任職。他告訴記者,跟以往的技術(shù)相比,新技術(shù)在所有指標上都有大幅度提高,讓單細胞擴增與測序更加精準。

首先,單細胞基因組經(jīng)LIANTI技術(shù)放大后,“噪音”非常小,這使測量基因拷貝數(shù)的精確度非常高。拷貝數(shù)是指某基因在基因組中的個數(shù)。人的體細胞內(nèi)基因拷貝數(shù)一般是兩個,分別來自父母,但在癌癥中基因拷貝數(shù)有可能變多或變少,在遺傳疾病中甚至有時缺失。許多癌癥和遺傳病都與拷貝數(shù)變異有關(guān)。

謝曉亮說,新技術(shù)使得測量拷貝數(shù)的空間分辨率提高了3個數(shù)量級,由此能查出基因組上以前查不出來的一些小段堿基微缺失。這意味著能更有效、更精準地檢測出更多遺傳疾病。

其次,測單堿基突變的靈敏度大大增強。單堿基突變是指基因組上只有一個堿基突變,它同樣有可能導致癌癥與遺傳病。

第三,新技術(shù)測量基因組的覆蓋率達到97%。也就是說,一個細胞基因組里97%的堿基可以測到。

謝曉亮說,LIANTI技術(shù)跟PCR(聚合酶鏈反應)技術(shù)類似,但不同的是,前者放大的不是單個基因,而是整個基因組。與PCR技術(shù)的指數(shù)放大方法相比,LIANTI技術(shù)的線性放大方法減少了“噪音”與錯誤。PCR技術(shù)是上世紀80年代發(fā)展起來的,其發(fā)明人因此獲得1993年諾貝爾化學獎。

對于新技術(shù)的意義,謝曉亮說,人的基因組時刻在變化,LIANTI技術(shù)使人們能了解細胞基因組怎樣隨時間推移而變化。臨床方面,可以用它來篩選沒有遺傳疾病的受精卵,從而幫助許多夫妻獲得健康后代;這項技術(shù)能在單細胞上看基因突變,對了解癌癥也非常重要。(記者林小春)

編輯:趙彥

關(guān)鍵詞:新技術(shù) 窺探更細微 基因變異

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