1931年11月，中華蘇維埃共和國臨時中央政府成立后，為解決蘇區(qū)軍民的看病問題，組織創(chuàng)立了專門的醫(yī)療機構(gòu)，并迅速建立起從中央到地方、從軍隊到政府的衛(wèi)生管理體系。

中央軍委成立了總衛(wèi)生部，下設(shè)總務(wù)處、醫(yī)政局、保健局、衛(wèi)生材料廠、醫(yī)院政治部。蘇區(qū)政府設(shè)立衛(wèi)生管理局，專門負責人民衛(wèi)生健康事業(yè)。在中央內(nèi)務(wù)人民委員部內(nèi)設(shè)立衛(wèi)生管理局，下設(shè)藥品藥材科。隨著形勢發(fā)展的需要，衛(wèi)生管理局將藥品藥材科升格為藥品管理處，主要負責蘇區(qū)藥品藥材的生產(chǎn)、供應(yīng)、調(diào)撥、管理、檢查與監(jiān)督工作。

為了加強藥品藥材管理，中央政府、中央軍委衛(wèi)生部門先后頒布《衛(wèi)生運動指南》《傳染病預(yù)防條例》等文件，對藥物購銷、生產(chǎn)、使用、保管、發(fā)放、供應(yīng)、監(jiān)督等工作作出了明確規(guī)定。從1933年起，中央蘇區(qū)各級地方政府成立了衛(wèi)生運動委員會，省、縣設(shè)立衛(wèi)生部，區(qū)、鄉(xiāng)設(shè)衛(wèi)生委員會和衛(wèi)生員，管理轄區(qū)的衛(wèi)生行政、衛(wèi)生建設(shè)和衛(wèi)生教育等事務(wù)。中央、省、縣、鄉(xiāng)醫(yī)療衛(wèi)生機構(gòu)免費給群眾看病，教育紅軍指戰(zhàn)員和人民群眾破除陳規(guī)陋習(xí)，講究衛(wèi)生，堅決同一切不衛(wèi)生習(xí)慣作斗爭。

為了培養(yǎng)藥品專門人才，紅軍衛(wèi)生學(xué)校（前身為軍醫(yī)學(xué)校）每期招生都會招收藥劑、司藥專業(yè)學(xué)員。中央藥材局也多次舉辦藥品材料加工生產(chǎn)培訓(xùn)班，蘇區(qū)衛(wèi)生部門為此組織人員編輯印發(fā)了大量包括有藥物學(xué)知識介紹的教材。受訓(xùn)學(xué)員中的許多人后來成為醫(yī)療衛(wèi)生戰(zhàn)線的領(lǐng)導(dǎo)、骨干和專家。

中央紅色總醫(yī)院成立后，除有診察室外，還設(shè)有手術(shù)室、藥房、化驗室、中草藥制劑車間、放射室等。醫(yī)院除收治病人外，還自行生產(chǎn)、制作一般的衛(wèi)生材料、中草藥劑等，化驗有關(guān)藥品的性能與質(zhì)量，防止中毒受害。此外，中央蘇區(qū)還先后建立了10所后方醫(yī)院、10所預(yù)備醫(yī)院、6所兵站醫(yī)院，2所殘廢醫(yī)院和1個療養(yǎng)院，約能收容傷病員兩萬多人。這些醫(yī)療機構(gòu)內(nèi)都有專門的藥品藥材管理科室。

中央蘇區(qū)成立之初，為了解決蘇區(qū)軍民藥品藥材供給緊缺的困難，主要采取三種方式應(yīng)對：上山采集、戰(zhàn)場繳獲、通過地下交通員從國統(tǒng)區(qū)秘密購買。1932年10月，臨時中央政府在瑞金創(chuàng)辦了中央衛(wèi)生材料廠。廠部設(shè)生產(chǎn)、技術(shù)、采購、檢驗、保管、供應(yīng)等科室，并根據(jù)生產(chǎn)種類劃分了制藥、敷料、酒精、水劑、器材等車間，工人與技術(shù)人員最多時達200余人。該廠克服重重困難，很快生產(chǎn)出丸、散、膏、丹各類藥品以及酒精、敷料、手術(shù)刀、鑷子、鉗子、打丸機、壓氣機、蒸氣消毒機，并將產(chǎn)品分送各紅軍醫(yī)院使用，在很大程度上緩解了中央蘇區(qū)醫(yī)療器械和藥材供應(yīng)困難。